Eine Hypothese ist eine wissenschaftliche Aussage, die am Beginn einer Studie steht.

Um die Hypothese abzusichern, ist zunächst eine logisch konsistente Theorie herzuleiten. Da diese aber in der Medizin niemals vollständig sein kann, sind außerdem Daten zu erheben und zu analysieren.

Siehe auch: Alternativhypothese und Nullhypothese

Hypothesenformulierung: Arten von Hypothesen, bei denen nichts über die Richtung eines Unterschieds ausgesagt wird, nennt man zweiseitig (oder ungerichtet).
Liegen aufgrund inhaltlicher Überlegungen bereits Kenntnisse über die Richtung eines möglichen Unterschiedes vor, ist es eventuell sinnvoll, einseitige (oder gerichtete) Hypothesen zu formulieren.